Animisme di Malaysia atau agama rakyat Malaysia merujuk kepada kepercayaan dan amalan animistik dan politeistik yang masih dipegang oleh ramai di negara majoriti Islam Malaysia. Agama rakyat Malaysia diamalkan sama ada secara terbuka atau tersendiri bergantung kepada jenis ritual yang dilakukan.Beberapa bentuk kepercayaan tidak diiktiraf oleh kerajaan sebagai agama untuk tujuan statistik walaupun amalan tersebut tidak dilarang. Terdapat interaksi yang mendalam antara agama rakyat Cina tentang penduduk China yang besar di Malaysia, dan agama rakyat Malaysia yang asli.